20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1427 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  100 
 
 
290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  41.13 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  35.27 
 
 
371 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  30.21 
 
 
287 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.68 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  32.86 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  23.24 
 
 
439 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  25.29 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  27.39 
 
 
428 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  28.43 
 
 
429 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.21 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  29.72 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  31.54 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  33.08 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  27.57 
 
 
429 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
360 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  31.53 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  26.23 
 
 
353 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28.91 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>