20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2037 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  100 
 
 
328 aa  672    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 
360 aa  202  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  29.6 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  31.25 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  24.73 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  27.08 
 
 
428 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  29.47 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  30.89 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  30.23 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28.42 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  25.44 
 
 
276 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  29.15 
 
 
371 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  27.04 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  22.57 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33311  predicted protein  24.68 
 
 
663 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.567773  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  23.18 
 
 
355 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  29.25 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29087  predicted protein  28.57 
 
 
480 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28.21 
 
 
288 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  24.11 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>