26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0478 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  39.86 
 
 		 167 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  42.36 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  37.25 
 
 		 179 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  41.55 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  39.13 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  39.58 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  38.62 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  38.1 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  42.19 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  34.46 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  38.84 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  33.78 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  33.78 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  33.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  33.78 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  31.21 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  31.21 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  31.11 
 
 		 337 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  29.86 
 
 		 286 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  30.22 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  29.08 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  28.26 
 
 		 272 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  28.41 
 
 		 175 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>