50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2345 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2345  heme oxygenase (decyclizing)  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0441  Heme oxygenase  57.48 
 
 
235 aa  248  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3241  Heme oxygenase  49.02 
 
 
217 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00174182  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  49.3 
 
 
217 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4613  Heme oxygenase  50 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2758  Heme oxygenase  48.28 
 
 
216 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2962  Heme oxygenase  40.85 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0335  Heme oxygenase (decyclizing)  39.44 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0979075  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3635  Heme oxygenase  39.91 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3872  Heme oxygenase  45.93 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  normal  0.243926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0079  Heme oxygenase  43.54 
 
 
223 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1054  Heme oxygenase  44.24 
 
 
222 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.623466  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0196  Heme oxygenase (decyclizing)  38.03 
 
 
243 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0166  Heme oxygenase (decyclizing)  38.5 
 
 
237 aa  165  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3767  Heme oxygenase  38.97 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00293088  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1858  Heme oxygenase (decyclizing)  39.81 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206398  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2851  heme oxygenase  38.97 
 
 
238 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1380  Heme oxygenase  37.56 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1414  Heme oxygenase  37.56 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17151  Heme oxygenase  37.26 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.714978  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35580  heme oxygenase  43.14 
 
 
216 aa  161  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4780  Heme oxygenase  39.71 
 
 
251 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3827  Heme oxygenase  35.78 
 
 
237 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1686  Heme oxygenase  34.95 
 
 
236 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.454788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1169  Heme oxygenase  35.35 
 
 
235 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20441  Heme oxygenase  35.35 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.810996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22411  Heme oxygenase  37.67 
 
 
239 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0098  Heme oxygenase  38.42 
 
 
256 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0101  Heme oxygenase  38.42 
 
 
256 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3085  Heme oxygenase  46.15 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18031  Heme oxygenase  33.98 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17861  Heme oxygenase  33.98 
 
 
236 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17811  Heme oxygenase  33.5 
 
 
236 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2604  Heme oxygenase  37.32 
 
 
248 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1431  Heme oxygenase  33.49 
 
 
230 aa  134  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3387  heme oxygenase  32.42 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562296  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5902  predicted protein  35.96 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  36.84 
 
 
215 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12588  predicted protein  37.02 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0203  heme oxygenase 2  32.37 
 
 
214 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0205  heme oxygenase  32.37 
 
 
214 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1310  Heme oxygenase (decyclizing)  33.5 
 
 
226 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1727  Heme oxygenase  30.52 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08750  heme oxygenase  37.1 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3739  Heme oxygenase (decyclizing)  28.64 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0567134  hitchhiker  0.000363645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6429  heme oxygenase  32.98 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3984  Heme oxygenase (decyclizing)  29.58 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85445  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01200  heme oxygenase 2, putative  25.19 
 
 
364 aa  58.5  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89558  predicted protein  23.7 
 
 
221 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27472  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0288  hypothetical protein  30.6 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>