54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0143 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0143  ETC complex I subunit region  100 
 
 		 103 aa  216  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00000705205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  74.76 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  67.96 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  66.02 
 
 		 103 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  66.02 
 
 		 103 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  66.02 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  66.02 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  66.02 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  59.8 
 
 		 218 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  61.17 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  58.25 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  55.34 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  57.84 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  50.49 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  56.86 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  54.37 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  55.34 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  52.43 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  51.46 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  51.46 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  53.4 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  51.46 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  52.94 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  53.4 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  56.73 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  54.37 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  54.9 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  53.92 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  53.92 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  52.43 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  50.96 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  52.83 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  52.83 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  51.46 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  48.54 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  52.69 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  49.51 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  55.91 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  47.62 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  41.75 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0791  ETC complex I subunit region  45.45 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.85667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  48.35 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  42.42 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  38.78 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  41.3 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  41.33 
 
 		 250 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0173  oxidoreductase, putative  38.46 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.042718  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  45.31 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  42.86 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07497  NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05500)  36.17 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62206  NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-21KD) (CI-21KD)  34.95 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.246084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  38.1 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  35.21 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>