18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1072 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  100 
 
 		 871 aa  1785    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  41.62 
 
 		 868 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  34.17 
 
 		 612 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  27.57 
 
 		 820 aa  252  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  26.34 
 
 		 878 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  27.48 
 
 		 863 aa  201  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  26.32 
 
 		 867 aa  192  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  26.25 
 
 		 868 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  49.14 
 
 		 198 aa  173  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 		 903 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  23.38 
 
 		 895 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  22.81 
 
 		 862 aa  127  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  21.64 
 
 		 843 aa  126  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  24.55 
 
 		 701 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  27.58 
 
 		 919 aa  94.4  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 607 aa  50.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.73 
 
 		 527 aa  49.7  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>