23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0084 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0084  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  460  1e-128  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.956959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0222  hypothetical protein  47.14 
 
 
231 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.01063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4446  hypothetical protein  46.61 
 
 
229 aa  208  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4211  hypothetical protein  44.39 
 
 
223 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2837  hypothetical protein  44.8 
 
 
230 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3286  hypothetical protein  44.34 
 
 
230 aa  183  2e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1290  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000122843  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3097  hypothetical protein  39.38 
 
 
200 aa  147  1e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_6402  predicted protein  40.59 
 
 
170 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35719  predicted protein  31.25 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.443367  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18697  predicted protein  31.71 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00308277  hitchhiker  0.000619104 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0665  hypothetical protein  34.17 
 
 
215 aa  83.2  3e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.402114  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1695  hypothetical protein  33.96 
 
 
215 aa  81.6  9e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16471  predicted protein  25.49 
 
 
207 aa  63.5  3e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47423  predicted protein  37.84 
 
 
542 aa  50.4  3e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
633 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.48 
 
 
615 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
617 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  31.58 
 
 
629 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.97 
 
 
618 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.19 
 
 
624 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 
646 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.71 
 
 
605 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>