20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0044 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  33.15 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  24.74 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  22.17 
 
 
272 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  25.14 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  23.12 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  25.26 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  25.14 
 
 
305 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  24.77 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  23.63 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  27.03 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  22.6 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  24.59 
 
 
323 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  23.28 
 
 
287 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  26.63 
 
 
241 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  23.66 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  26.47 
 
 
476 aa  45.1  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  22.38 
 
 
524 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.5 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>