27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0054 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  74.21 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  57.72 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  54.19 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  54.36 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  54.36 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  53.69 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  48.39 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  51.61 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  54.84 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  53.54 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  63.33 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  32.47 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  34.23 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  29.49 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  29.68 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  30.14 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  27.69 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  35.14 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  26.92 
 
 		 153 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>