264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0013 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
287 aa  602  1e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  97.21 
 
 
287 aa  591  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  95.12 
 
 
301 aa  581  1e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  91.29 
 
 
301 aa  564  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87933e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  91.64 
 
 
287 aa  562  1e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78552e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.59 
 
 
301 aa  560  1e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85129e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
301 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
301 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39617e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
301 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
301 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
301 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.67 
 
 
301 aa  523  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.67 
 
 
301 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.62 
 
 
311 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  81.53 
 
 
302 aa  514  1e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.49 
 
 
304 aa  506  1e-142  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  504  1e-142  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.77 
 
 
309 aa  506  1e-142  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.44 
 
 
304 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
304 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.79 
 
 
303 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.75 
 
 
304 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.4 
 
 
304 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.4 
 
 
304 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.4 
 
 
304 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2498  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.23 
 
 
330 aa  491  1e-138  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2964  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  81.18 
 
 
310 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.62 
 
 
315 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  1.12208e-10 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.92 
 
 
308 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.62 
 
 
315 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
315 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.97 
 
 
315 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1232  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.66 
 
 
303 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.97 
 
 
315 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.78016e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
315 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  8.95825e-12 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  81.6 
 
 
305 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.57 
 
 
315 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
318 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.22 
 
 
317 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001999  glycyl-tRNA synthetase alpha chain  80.9 
 
 
305 aa  474  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.14 
 
 
306 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  76.92 
 
 
315 aa  470  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
335 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.96 
 
 
318 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.27 
 
 
317 aa  469  1e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.84 
 
 
309 aa  470  1e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.87 
 
 
364 aa  469  1e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.69 
 
 
323 aa  468  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.52 
 
 
308 aa  466  1e-130  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.57 
 
 
350 aa  464  1e-130  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.57 
 
 
329 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03831  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.96 
 
 
302 aa  459  1e-128  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.56 
 
 
303 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.33 
 
 
314 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0888  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.87 
 
 
307 aa  451  1e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.87 
 
 
307 aa  451  1e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0761934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  73.68 
 
 
314 aa  452  1e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.08 
 
 
319 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.08 
 
 
319 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.13 
 
 
317 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1805  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.17 
 
 
301 aa  446  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.17 
 
 
301 aa  446  1e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.47 
 
 
304 aa  445  1e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0448  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.11 
 
 
317 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0406  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.73 
 
 
335 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.995928  normal  0.36561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.03 
 
 
317 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0161  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.34 
 
 
302 aa  436  1e-121  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.34 
 
 
294 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.1 
 
 
308 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0509  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.22 
 
 
322 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00315441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.03 
 
 
317 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2431  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0717  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.34 
 
 
296 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0702  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2618  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
334 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.05 
 
 
335 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0984004  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2701  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.39 
 
 
334 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0131635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.28 
 
 
301 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.05 
 
 
335 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0398662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>