36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1208 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  197  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  40.86 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  36.08 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  32.61 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  36.67 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  30.43 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  31.18 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  25.53 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  22.83 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  26.97 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  28.28 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  26.04 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0931  hypothetical protein  29.27 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  27.37 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  27.37 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  30.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  27.63 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1152  hypothetical protein  29.07 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  23.23 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  29.03 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  30.34 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  24.49 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  30.59 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  24.24 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  24.24 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  23.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0274  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  23.23 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  20.2 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>