15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0903 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  216  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  99.1 
 
 		 111 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  56.48 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  56.38 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  53.19 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  38.71 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  28.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  35.42 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  32.29 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  28.12 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  27.08 
 
 		 100 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  24.49 
 
 		 107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  24.49 
 
 		 107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>