16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2341 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  208  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  41.44 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  38.71 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  38.71 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  36.04 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  38 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  31.13 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  29.47 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  32.32 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  34.02 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  27.37 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  29.07 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  27.96 
 
 
106 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  24.74 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  24.74 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>