23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0332 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2894  hypothetical protein  86.92 
 
 
107 aa  189  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0388565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  68.22 
 
 
107 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  68.22 
 
 
107 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  69.16 
 
 
108 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  69.81 
 
 
108 aa  156  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3859  hypothetical protein  66.98 
 
 
107 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2355  hypothetical protein  58.88 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0875  hypothetical protein  48.54 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.223347  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1523  hypothetical protein  48.31 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  28.57 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  26.6 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  27.08 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2587  hypothetical protein  25.45 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  28.42 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  25.51 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  22.11 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1152  hypothetical protein  25.88 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  27.19 
 
 
309 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  20.2 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  23.42 
 
 
261 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  23.42 
 
 
261 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>