More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
498 aa  985    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1354  Leucyl aminopeptidase  68.51 
 
 
499 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  60.09 
 
 
515 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  57.91 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2938  leucyl aminopeptidase  62.47 
 
 
505 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  60.83 
 
 
513 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  60.83 
 
 
513 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  60.83 
 
 
513 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3575  leucyl aminopeptidase  60.88 
 
 
510 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00437007  normal  0.0600752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12241  leucyl aminopeptidase  60.52 
 
 
515 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.299314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3358  Leucyl aminopeptidase  54.27 
 
 
502 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  51.63 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  51.92 
 
 
502 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  50.4 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  49.8 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  51.19 
 
 
545 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  52.41 
 
 
490 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1834  leucyl aminopeptidase  51.19 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3549  leucyl aminopeptidase  52.7 
 
 
521 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.984624  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  52.01 
 
 
490 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0945  Leucyl aminopeptidase  51.3 
 
 
495 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.593268  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0995  leucyl aminopeptidase  53.72 
 
 
499 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.842582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1867  Leucyl aminopeptidase  60.47 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00187713  decreased coverage  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3317  leucyl aminopeptidase  50.57 
 
 
521 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  49.8 
 
 
497 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3133  leucyl aminopeptidase  49.7 
 
 
531 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.100377  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  51.67 
 
 
493 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13310  leucyl aminopeptidase  47.22 
 
 
510 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0623814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  51 
 
 
499 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  49.19 
 
 
492 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  50.82 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2098  Leucyl aminopeptidase  53.36 
 
 
499 aa  353  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.827384  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0937  leucyl aminopeptidase  46.92 
 
 
537 aa  353  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1781  leucyl aminopeptidase  48.03 
 
 
537 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228538  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3276  Leucyl aminopeptidase  52.64 
 
 
499 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187039  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.64 
 
 
492 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16320  leucyl aminopeptidase  45.01 
 
 
524 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197176  normal  0.502851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  38.17 
 
 
504 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  43.42 
 
 
488 aa  312  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
492 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.47 
 
 
511 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  41.99 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.91 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.3 
 
 
497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0837  Leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
483 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.775484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 
482 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.77 
 
 
487 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
496 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.87 
 
 
496 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 
495 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 
496 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 
495 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
512 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.95 
 
 
496 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  41.68 
 
 
496 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
497 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  37.02 
 
 
497 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
503 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  41.01 
 
 
497 aa  289  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  39.06 
 
 
495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.06 
 
 
495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  39.79 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
501 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  37.4 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  41 
 
 
496 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  38.9 
 
 
500 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
498 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  46.22 
 
 
488 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  36.76 
 
 
495 aa  282  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  39.86 
 
 
493 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  36.05 
 
 
506 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 
518 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  38.29 
 
 
503 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  41.84 
 
 
492 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  35.61 
 
 
495 aa  279  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  46.34 
 
 
491 aa  279  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  35.41 
 
 
501 aa  279  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  37.65 
 
 
518 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  38.09 
 
 
503 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  38.54 
 
 
499 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  43.77 
 
 
474 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 
503 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 
503 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 
503 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  36.33 
 
 
508 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  35.58 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  45.92 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  36.74 
 
 
503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
478 aa  274  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  47.04 
 
 
530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>