30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0647 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0647  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
106 aa  208  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000033306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1669  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
114 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.856867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4259  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 
478 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0277148  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  46.81 
 
 
901 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0444  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  51.85 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0435  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  51.85 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.71 
 
 
846 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  37.5 
 
 
885 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 
478 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  36 
 
 
885 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  43.59 
 
 
910 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  34.69 
 
 
885 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  41.03 
 
 
894 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.98 
 
 
520 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000338816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.67 
 
 
870 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  38 
 
 
1328 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 
897 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  36 
 
 
885 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
1180 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44 
 
 
827 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  34.62 
 
 
839 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.33 
 
 
942 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  41.03 
 
 
895 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  43.59 
 
 
804 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  41.03 
 
 
895 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42 
 
 
819 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  42 
 
 
819 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 
1228 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1344  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38 
 
 
865 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.451527  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
64 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.117505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>