31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2761 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  58.27 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  41.26 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  30.92 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  29.84 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  28.17 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  27.48 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  29.66 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  27.56 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  28.68 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  29.09 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  30.63 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  31.53 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  27.94 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.28 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26.57 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  30.28 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  30.28 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  32.2 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  30.63 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  29.6 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  26.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  28.95 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  25.18 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  26.03 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  23.2 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  24.5 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.540615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>