138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1001 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1001  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  62.23 
 
 		 188 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2208  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.500142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003193  hypothetical protein  46.47 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  34.65 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  35.44 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.71 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0310  acetyltransferase  25.6 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.944664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  30 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  35.92 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1002  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4699  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  35.29 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4189  acetyltransferase, GNAT family  30.11 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1117  acetyltransferase, GNAT family  30.43 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  33.71 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0999  acetyltransferase  26.47 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1059  acetyltransferase  25 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1163  acetyltransferase, GNAT family  26.47 
 
 		 169 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0187  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2686  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2943  acetyltransferase, GNAT family  26 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0987554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  33.33 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2302  acetyltransferase, GNAT family  25.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00735826  hitchhiker  0.00000000000000286174 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  32.41 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  32.41 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  32.41 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  32.41 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4547  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  29.13 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0866  acetyltransferase  29.31 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  32.41 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2657  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0130376  normal  0.0628799 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  32.41 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2975  acetyltransferase  32.94 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0715346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  29.13 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  25.58 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09204  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14730)  31.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  27.46 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  26.24 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  26 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1013  acetyltransferase  34.29 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  26.24 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  26.24 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2657  acetyltransferase  32.94 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.595314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1085  acetyltransferase  34.29 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.919311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  26.24 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2983  acetyltransferase, GNAT family  24.67 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2937  acetyltransferase, GNAT family  24.67 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29735e-47 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2680  acetyltransferase  24.67 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000272485  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  30.85 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  35.94 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  25.53 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3736  putative acetyltransferase YhhY  26.13 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3747  putative acetyltransferase YhhY  26.13 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_002620  TC0743  acetyltransferase  27.07 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.267097  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41476  predicted protein  37.97 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2792  acetyltransferase  28.28 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  40.38 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06852  hypothetical protein  33.73 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  23.42 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3916  putative acetyltransferase YhhY  25.23 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.73756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.25 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46090  predicted protein  33.33 
 
 		 282 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2938  acetyltransferase  24 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>