19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0072 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  60.84 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  60.56 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  60.84 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  52.86 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  28.23 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  32.58 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  25.76 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  29.84 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  27.42 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  27.42 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3599  ATPases involved in pili biogenesis, PilT  25 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  23.66 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  26.61 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0888  FlgN family protein  28.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0650773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  27.54 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  27.94 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17150  hypothetical protein  22.97 
 
 		 162 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>