52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0052 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0052  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0058  flagellar basal body-associated protein FliL  58.04 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  53.95 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3450  flagellar basal body-associated protein FliL  52.26 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3951  flagellar basal body-associated protein FliL  51.61 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001168  flagellar biosynthesis protein FliL  35.4 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04952  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  25.74 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0190  hypothetical protein  25.97 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.952719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  23.4 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  30.12 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  31.58 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  28.43 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  28.43 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.58 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  28.43 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  22.86 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.85 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  24.53 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.32 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  25.32 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0769  flagellar basal body-associated protein FliL  26.21 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.32 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  23.58 
 
 		 179 aa  43.9  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  21.78 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  29.47 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  30.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  29.47 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  26.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  22.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  22.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.11 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  25.26 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  21.9 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>