26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  881    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3658  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.29 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0399  zinc carboxypeptidase family protein  32.14 
 
 		 445 aa  252  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1977  hypothetical protein  36.61 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.3 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  27.57 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.65 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.61 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  31.82 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.7 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.39 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  31.13 
 
 		 242 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 		 563 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.46 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  30.46 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.95 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  30.46 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  30.46 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  30.46 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  30.46 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  29.8 
 
 		 242 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  28.77 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  30.46 
 
 		 242 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  30.69 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.43 
 
 		 563 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.9 
 
 		 599 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>