16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0693 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  73.44 
 
 
577 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1128    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  55.44 
 
 
568 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  55.21 
 
 
552 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  53.31 
 
 
543 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  51.61 
 
 
572 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  51.7 
 
 
572 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  52.13 
 
 
572 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  51.76 
 
 
569 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  50.74 
 
 
573 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  46.79 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  46.62 
 
 
555 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  48.43 
 
 
476 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  58.93 
 
 
56 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  28.81 
 
 
449 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  30.08 
 
 
450 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>