278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1163 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
127 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  90.48 
 
 
127 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  89.68 
 
 
127 aa  201  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  90.48 
 
 
127 aa  200  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  89.68 
 
 
127 aa  199  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  84.92 
 
 
127 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  84.13 
 
 
127 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  84.13 
 
 
127 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  83.33 
 
 
127 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  75.4 
 
 
126 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.48 
 
 
125 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.47 
 
 
132 aa  151  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  72.22 
 
 
126 aa  150  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.15 
 
 
131 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.47 
 
 
132 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.18 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
126 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.48 
 
 
126 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.48 
 
 
126 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 
126 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  57.48 
 
 
126 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 
126 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
126 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.27 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  133  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
126 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  56 
 
 
126 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 
126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.91 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.91 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.33 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  52.38 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.85 
 
 
126 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.85 
 
 
126 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.21 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.97 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.82 
 
 
127 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.46 
 
 
127 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.4 
 
 
130 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.09 
 
 
142 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.34 
 
 
123 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.19 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.6 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.97 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
133 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.24 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
125 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.31 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.64 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.64 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.62 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.54 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 
139 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
137 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.8 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 
133 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
134 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  39.84 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0796  Holo-acyl carrier protein synthase  47.54 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.78 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.78 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.91 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>