72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0034 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0034  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  320  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0034  protein of unknown function DUF494  88.54 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.45632e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0035  hypothetical protein  88.54 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0027  hypothetical protein  88.54 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0030  hypothetical protein  88.54 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0034  hypothetical protein  88.54 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0038  hypothetical protein  87.34 
 
 
158 aa  283  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272353  hitchhiker  4.78432e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3733  hypothetical protein  87.26 
 
 
157 aa  282  1e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0219061  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0035  smg protein  87.34 
 
 
158 aa  282  1e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0030  hypothetical protein  87.34 
 
 
158 aa  282  1e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0032  hypothetical protein  87.34 
 
 
158 aa  282  1e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.263953  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0027  hypothetical protein  86.62 
 
 
157 aa  282  2e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0027  hypothetical protein  85.99 
 
 
157 aa  281  3e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0038  hypothetical protein  85.99 
 
 
157 aa  279  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0240972  normal  0.0588054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0041  hypothetical protein  82.17 
 
 
157 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.479355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0046  hypothetical protein  69.81 
 
 
159 aa  233  1e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.249681  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00025  smg protein  65.19 
 
 
158 aa  207  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0026  hypothetical protein  66.04 
 
 
158 aa  202  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0023  smg protein  62.42 
 
 
157 aa  198  2e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4509  hypothetical protein  59.24 
 
 
157 aa  195  2e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000588298  hitchhiker  0.000163466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0358  hypothetical protein  61.15 
 
 
157 aa  194  5e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0362316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3966  hypothetical protein  59.09 
 
 
157 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0441  hypothetical protein  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3880  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  189  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000155024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0318  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  189  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0619  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  189  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000133668  normal  0.0223362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3787  hypothetical protein  59.74 
 
 
157 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00193102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3669  hypothetical protein  59.24 
 
 
157 aa  184  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03135  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0891254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0429  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.5196e-05  hitchhiker  0.000953721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3478  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.37993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03086  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0429  protein of unknown function DUF494  58.6 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0295235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3716  hypothetical protein  57.96 
 
 
157 aa  182  1e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195786  hitchhiker  0.0087907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3767  hypothetical protein  57.96 
 
 
157 aa  182  2e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000724852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4607  hypothetical protein  57.96 
 
 
157 aa  182  2e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0145872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3580  hypothetical protein  57.96 
 
 
157 aa  182  2e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0216587  normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0078  hypothetical protein  56.69 
 
 
157 aa  181  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3673  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3708  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0588951  normal  0.0775927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3601  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.967939  normal  0.75952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3600  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.4697e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3771  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2470  hypothetical protein  57.32 
 
 
158 aa  178  3e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00388  hypothetical protein  56.33 
 
 
159 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002060  hypothetical protein  56.96 
 
 
159 aa  173  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3011  hypothetical protein  51.28 
 
 
159 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2840  hypothetical protein  45.51 
 
 
155 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0192  hypothetical protein  46.79 
 
 
158 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2325  hypothetical protein  44.87 
 
 
156 aa  139  2e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.801617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2631  hypothetical protein  47.68 
 
 
157 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1868  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1932  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0075  hypothetical protein  40.76 
 
 
157 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04052  hypothetical protein  46.31 
 
 
157 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3588  hypothetical protein  46.31 
 
 
157 aa  118  2e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2089  protein of unknown function DUF494  40.74 
 
 
166 aa  116  1e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.596862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2276  protein of unknown function DUF494  43.24 
 
 
161 aa  115  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0190  hypothetical protein  37.18 
 
 
150 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0087  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.55352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2099  smg protein  35.26 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000321038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0347  hypothetical protein  35.61 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0637077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0280  hypothetical protein  39.39 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0612499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0098  protein of unknown function DUF494  38.69 
 
 
156 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3882  hypothetical protein  34.44 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4642  hypothetical protein  32.45 
 
 
172 aa  78.6  3e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196493  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3863  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  77.8  6e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5116  protein of unknown function DUF494  30.41 
 
 
172 aa  73.2  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0011  Smg protein  30.19 
 
 
148 aa  66.2  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0017  protein of unknown function DUF494  33.04 
 
 
146 aa  63.5  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  0.0565587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0016  smg family protein  33.04 
 
 
146 aa  63.5  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0407  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  60.1  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.67933e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>