More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2572 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  48.71 
 
 		 776 aa  713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  49.48 
 
 		 727 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  95.55 
 
 		 764 aa  1497    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  92.02 
 
 		 764 aa  1454    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  52.88 
 
 		 758 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  47.85 
 
 		 778 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  49.93 
 
 		 770 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  46.79 
 
 		 774 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  49.21 
 
 		 786 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  93.85 
 
 		 764 aa  1476    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  92.41 
 
 		 764 aa  1461    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  79.97 
 
 		 764 aa  1273    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  92.41 
 
 		 764 aa  1460    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  75.32 
 
 		 772 aa  1194    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  52.65 
 
 		 758 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  53.37 
 
 		 758 aa  787    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  77.33 
 
 		 764 aa  1248    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  48.83 
 
 		 786 aa  711    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  99.21 
 
 		 764 aa  1543    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 764 aa  1556    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  72.24 
 
 		 770 aa  1165    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  79.71 
 
 		 764 aa  1276    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  92.54 
 
 		 764 aa  1461    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  45.97 
 
 		 783 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  97.51 
 
 		 764 aa  1522    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  48.99 
 
 		 774 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  46.51 
 
 		 751 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  78.53 
 
 		 764 aa  1218    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  53.17 
 
 		 758 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  79.06 
 
 		 764 aa  1246    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  49.93 
 
 		 770 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  45.12 
 
 		 778 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  45.26 
 
 		 751 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  42.97 
 
 		 769 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  44.89 
 
 		 751 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  40.75 
 
 		 816 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  40.75 
 
 		 816 aa  586  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  43.62 
 
 		 766 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  42.49 
 
 		 778 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  43.14 
 
 		 766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  41.9 
 
 		 693 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  41.02 
 
 		 766 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  41.02 
 
 		 782 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  42.95 
 
 		 771 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  42.5 
 
 		 771 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  42.5 
 
 		 771 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  41.4 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  42.61 
 
 		 771 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  41.26 
 
 		 773 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  41.4 
 
 		 772 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  41.4 
 
 		 772 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  41.39 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  41.67 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  41.4 
 
 		 772 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  41.4 
 
 		 772 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  37.35 
 
 		 683 aa  475  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  37.53 
 
 		 747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  35.8 
 
 		 741 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  36.1 
 
 		 743 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  36.22 
 
 		 713 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  37.78 
 
 		 631 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 		 741 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  35.91 
 
 		 738 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  35.96 
 
 		 728 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  37.18 
 
 		 740 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  35.91 
 
 		 680 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.92 
 
 		 631 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  36.96 
 
 		 740 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 		 753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  35.55 
 
 		 676 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.99 
 
 		 587 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.99 
 
 		 587 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  35.42 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  34.51 
 
 		 715 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  35.13 
 
 		 662 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  34.25 
 
 		 708 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  35.13 
 
 		 662 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  37.98 
 
 		 741 aa  399  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  35.04 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  396  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  34.72 
 
 		 662 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  35.9 
 
 		 665 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  35.1 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  34.03 
 
 		 721 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  33.98 
 
 		 669 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 		 664 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>