15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0641 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0641  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  2.81394e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3379  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  610  1e-174  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000346578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0641  hypothetical protein  93.77 
 
 
290 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  2.77282e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4005  hypothetical protein  82.35 
 
 
290 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0670  hypothetical protein  76.47 
 
 
290 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0597  hypothetical protein  73.36 
 
 
290 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3671  hypothetical protein  73.36 
 
 
290 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.286479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3854  hypothetical protein  73.7 
 
 
290 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.49063e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3728  hypothetical protein  72.2 
 
 
290 aa  404  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2988  hypothetical protein  44.37 
 
 
302 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0528  hypothetical protein  40.55 
 
 
334 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39040  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  110  2e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1854  hypothetical protein  27.8 
 
 
288 aa  68.6  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4083  hypothetical protein  23.72 
 
 
276 aa  62.8  7e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2242  hypothetical protein  28.1 
 
 
302 aa  60.8  2e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>