72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1896 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1869  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.43556e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1903  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00038231  normal  0.870775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2423  protein of unknown function DUF709  100 
 
 
92 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.16329e-07  hitchhiker  0.00842429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1896  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.45586e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2381  hypothetical protein  86.96 
 
 
92 aa  169  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.71137e-07  normal  0.19582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2249  hypothetical protein  85.87 
 
 
92 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.22271e-06  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2172  hypothetical protein  85.87 
 
 
92 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.19171e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1766  hypothetical protein  81.52 
 
 
92 aa  164  6e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.10205e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2575  hypothetical protein  82.61 
 
 
92 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1738  hypothetical protein  69.23 
 
 
92 aa  138  2e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1630  hypothetical protein  64.44 
 
 
95 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00174664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2443  hypothetical protein  64.44 
 
 
93 aa  124  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000239167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1929  hypothetical protein  58.7 
 
 
92 aa  123  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.93078e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2115  hypothetical protein  62.92 
 
 
93 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113125  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2518  hypothetical protein  61.8 
 
 
93 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2183  hypothetical protein  58.43 
 
 
93 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.67377e-06  unclonable  1.59603e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3517  hypothetical protein  57.3 
 
 
97 aa  112  1e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2802  hypothetical protein  55.43 
 
 
95 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01139  hypothetical protein  53.33 
 
 
98 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.118354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1076  hypothetical protein  55.29 
 
 
98 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000579005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2755  hypothetical protein  51.19 
 
 
90 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  8.27128e-11  hitchhiker  9.61265e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1941  hypothetical protein  51.85 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.2159e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1970  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000354905  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2469  protein of unknown function DUF709  47.25 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00179552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1665  hypothetical protein  47.25 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.83207e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1279  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.35197e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2446  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294082  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1323  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.27874e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1334  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0109557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01154  hypothetical protein  47.25 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0106801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2370  hypothetical protein  47.62 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.70648e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01164  hypothetical protein  47.25 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2237  protein of unknown function DUF709  51.22 
 
 
85 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.63331e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1953  hypothetical protein  46.07 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192868  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1955  protein YcgL  46.07 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00440976  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1504  hypothetical protein  46.07 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2012  hypothetical protein  46.07 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.159587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1998  protein of unknown function DUF709  47.73 
 
 
90 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  8.10525e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1320  protein YcgL  46.07 
 
 
136 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.04608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1544  hypothetical protein  48.24 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.90367e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004085  protein YcgL  49.41 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.71174e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2398  hypothetical protein  46.43 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00129219  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2120  hypothetical protein  46.43 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2009  hypothetical protein  46.43 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.61388e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2005  protein of unknown function DUF709  47.73 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0805  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.594534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01387  hypothetical protein  49.41 
 
 
93 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1068  hypothetical protein  47.06 
 
 
93 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3906  protein of unknown function DUF709  44.05 
 
 
86 aa  73.9  6e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3126  protein of unknown function DUF709  41.33 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.679303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0203  protein of unknown function DUF709  40.26 
 
 
82 aa  70.9  6e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.947238  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1339  hypothetical protein  36.14 
 
 
91 aa  66.2  1e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32960  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  64.7  4e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4096  hypothetical protein  40.54 
 
 
97 aa  63.5  9e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47450  hypothetical protein  40.54 
 
 
97 aa  63.5  9e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0238  hypothetical protein  32.53 
 
 
97 aa  63.5  1e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.67483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1462  hypothetical protein  38.75 
 
 
96 aa  60.5  9e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  35.21 
 
 
371 aa  59.7  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1298  hypothetical protein  37.84 
 
 
97 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4590  hypothetical protein  37.84 
 
 
97 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1609  hypothetical protein  35.71 
 
 
97 aa  59.3  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1774  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0857455  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4120  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02884  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  57  9e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3899  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  57  9e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.999369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2277  hypothetical protein  36.67 
 
 
96 aa  56.6  1e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1389  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1564  hypothetical protein  33.78 
 
 
97 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3921  hypothetical protein  32.43 
 
 
97 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2530  hypothetical protein  31.17 
 
 
97 aa  51.6  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1721  hypothetical protein  25.81 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  9.76518e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0800  hypothetical protein  27.27 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.96088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>