74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  229  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05570  hypothetical protein  66.96 
 
 
115 aa  168  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.579477  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1352  protein of unknown function DUF322  65.22 
 
 
115 aa  146  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000887072  normal  0.246118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0862  protein of unknown function DUF322  47.32 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000204946  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  39.32 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  39.32 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  35.51 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0791  hypothetical protein  39.5 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.967276  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  35.78 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  34.48 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  31.19 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  30.84 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  30.84 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  37.07 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  33.33 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  34.26 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  32.71 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  40.74 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  36.94 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  30.84 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1743  hypothetical protein  32.71 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  34.86 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  32.14 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000405379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  30.56 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1041  protein of unknown function DUF322  28.3 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0582694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  30.19 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  32.11 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1721  hypothetical protein  30.56 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101939  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  36.13 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  30.48 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  28.44 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  30.48 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  32.11 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  35.65 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  34.26 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1053  hypothetical protein  28.97 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  27.78 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1059  hypothetical protein  28.97 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  30.48 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0251  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  32.11 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  30.48 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  24.76 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  25.69 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  25.23 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  32.99 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  30.85 
 
 
237 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  30.48 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  22.43 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2996  protein of unknown function DUF322  30 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  25.24 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  22.22 
 
 
133 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  23.15 
 
 
130 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  28.57 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  23.85 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2786  hypothetical protein  28.41 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>