23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  219  1e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  34.85 
 
 
89 aa  52  3e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  37.1 
 
 
84 aa  50.4  7e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  34.92 
 
 
89 aa  49.7  1e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.16524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  34.78 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  48.9  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  48.1  3e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  33.8 
 
 
89 aa  48.1  4e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  30 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.31135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  30.43 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  29.17 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  26.76 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  28.17 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  34.48 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  36.07 
 
 
88 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.627e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  37.04 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  31.94 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  33.96 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>