29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3948 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  61.94 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  59.35 
 
 		 155 aa  173  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  57.42 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  62.2 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  47.74 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  48.39 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  66.3 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  29.45 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  29.11 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  30.38 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  27.14 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  31.78 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3780  hypothetical protein  23.88 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>