43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2272 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  84.25 
 
 		 262 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  80.47 
 
 		 261 aa  417  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  82.86 
 
 		 263 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  82.79 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  68.75 
 
 		 261 aa  350  8.999999999999999e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  68.36 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  64.39 
 
 		 278 aa  322  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  60.71 
 
 		 269 aa  291  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  52.8 
 
 		 503 aa  245  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  52.4 
 
 		 503 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  54.36 
 
 		 495 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  53.39 
 
 		 506 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  48.59 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  48.21 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  45.02 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  43.53 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  49.79 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  45.49 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  46.03 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  43.08 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  43.65 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  40.17 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  36.89 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  36.36 
 
 		 497 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  34.63 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  33.05 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  33.33 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  32.49 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  33.8 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  32.22 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  31.05 
 
 		 620 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  31.3 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  28.51 
 
 		 497 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  27.62 
 
 		 507 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  27.95 
 
 		 601 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  29.51 
 
 		 508 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  30.13 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  35.22 
 
 		 646 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  28.63 
 
 		 545 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  29.96 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  26.61 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>