102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1741 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  57.99 
 
 		 175 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  56.8 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  53.25 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  55.62 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  55.62 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  55.03 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  55.09 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  52.66 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  52.66 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  52.07 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  53.57 
 
 		 169 aa  187  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  51.48 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  51.48 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  53.53 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  55.03 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  44.72 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  43.75 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  45.78 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  45.78 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  45.78 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  45.71 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  42.35 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  44.03 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  46.3 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  49.33 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  43.37 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  45.7 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  41.18 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  42.77 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  45.75 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  45.1 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  45.1 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  45.1 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  45.1 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  45.03 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  45.7 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  44.16 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  44.85 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  44.63 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  39.41 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  32.88 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  32.88 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  31.82 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  32.16 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  29.82 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  27.75 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  28.48 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  33.79 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  32.67 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  34.04 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  30.99 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  30.83 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.54 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  32.61 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  33.56 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.37 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  27.27 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  27.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  32.61 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1623  disulfide bond formation protein B  27.89 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  30.28 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.6 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  32.24 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.55 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  30.94 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  29.29 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  30.61 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  25.83 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  30.47 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  25.83 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.78 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  32.32 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  28.19 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  27.08 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  28.47 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  28.06 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  27.81 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  27.97 
 
 		 161 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>