20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1723 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  92.73 
 
 
170 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  92.73 
 
 
110 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  94.37 
 
 
71 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  91.94 
 
 
62 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  59.82 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  55.36 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  52.29 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  52.29 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  52.29 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  52.29 
 
 
108 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  45.79 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  32.43 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  32.73 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  34.26 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  27.59 
 
 
125 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0940  protein of unknown function DUF1493  31 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.255022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  31.13 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  32.81 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  27.72 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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