More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2540 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  100 
 
 
463 aa  942  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  100 
 
 
463 aa  942  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  99.57 
 
 
463 aa  940  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  99.57 
 
 
463 aa  940  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  100 
 
 
463 aa  942  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  43.28 
 
 
444 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  43.11 
 
 
444 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  43.28 
 
 
444 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  43.28 
 
 
444 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  43.28 
 
 
444 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  43.28 
 
 
444 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  43.28 
 
 
444 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  43.28 
 
 
444 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  44.19 
 
 
446 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  43.05 
 
 
444 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  42.82 
 
 
444 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  39.76 
 
 
445 aa  348  8e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  39.76 
 
 
445 aa  348  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  37.07 
 
 
454 aa  308  1e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  36.38 
 
 
449 aa  306  5e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  36.38 
 
 
449 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  36.38 
 
 
449 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.15527e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  36.2 
 
 
449 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.67094e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  39.86 
 
 
448 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.48 
 
 
455 aa  305  1e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  36.16 
 
 
449 aa  305  1e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70433e-14 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  36.06 
 
 
449 aa  305  2e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.64698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  36.67 
 
 
449 aa  304  2e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.91973e-08  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  35.84 
 
 
449 aa  305  2e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  36.49 
 
 
449 aa  304  3e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  35.41 
 
 
449 aa  303  5e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  36.45 
 
 
449 aa  303  5e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.83 
 
 
448 aa  303  5e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0316  glycerol-3-phosphate transporter, authentic frameshift  53.99 
 
 
298 aa  303  6e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.32 
 
 
449 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  36.12 
 
 
449 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.66 
 
 
452 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.66 
 
 
452 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.12 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.12 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.12 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.12 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.12 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.78 
 
 
483 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.36 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  36.91 
 
 
449 aa  295  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.76 
 
 
449 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.74 
 
 
452 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.30916e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  35.78 
 
 
445 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.28 
 
 
457 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.44 
 
 
446 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  38.91 
 
 
450 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.71 
 
 
450 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.81 
 
 
451 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.76 
 
 
449 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  8.7639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  39.04 
 
 
452 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.12087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  39.04 
 
 
452 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.31 
 
 
449 aa  285  1e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  37.15 
 
 
452 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  35.71 
 
 
448 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  37.36 
 
 
450 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  32.08 
 
 
481 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.1877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  33.33 
 
 
457 aa  244  2e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  34.83 
 
 
459 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  34.83 
 
 
459 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  31.07 
 
 
456 aa  219  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0573  glycerol-3-phosphatase transporter  32.32 
 
 
459 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0030  sugar phosphate antiporter  33.87 
 
 
463 aa  213  5e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.668761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0033  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0037  phosphoglycerate transporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03550  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03492  hypothetical protein  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3879  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4174  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4253  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5096  sugar phosphate antiporter  32.82 
 
 
463 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0505973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4031  sugar phosphate antiporter  32.6 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.505576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3997  sugar phosphate antiporter  32.73 
 
 
463 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4013  sugar phosphate antiporter  32.73 
 
 
463 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4068  sugar phosphate antiporter  32.73 
 
 
463 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4118  sugar phosphate antiporter  32.73 
 
 
463 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4176  sugar phosphate antiporter  32.73 
 
 
463 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000092  hexose phosphate transport protein  31.92 
 
 
442 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.149187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  30.14 
 
 
455 aa  201  2e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  29.28 
 
 
455 aa  200  4e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3501  sugar phosphate antiporter  31.02 
 
 
463 aa  199  8e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.547984  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  29.34 
 
 
446 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  30.58 
 
 
439 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  30.58 
 
 
439 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  29.67 
 
 
443 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  30.58 
 
 
439 aa  193  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  30.58 
 
 
439 aa  193  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  30.58 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  30.58 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>