209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0980 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  100 
 
 
99 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  75.76 
 
 
99 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  70.97 
 
 
106 aa  137  4e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  69.89 
 
 
97 aa  136  8e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  69.89 
 
 
106 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  69.89 
 
 
106 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  68.82 
 
 
106 aa  135  3e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  68.09 
 
 
106 aa  132  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  64.65 
 
 
106 aa  132  1e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  68.09 
 
 
106 aa  132  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  61.62 
 
 
99 aa  132  1e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  68.82 
 
 
97 aa  132  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  60.61 
 
 
99 aa  129  1e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  60.61 
 
 
99 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  61.62 
 
 
99 aa  125  2e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  57.45 
 
 
106 aa  116  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.09706e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  57.45 
 
 
106 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  57.45 
 
 
106 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  57.89 
 
 
104 aa  115  2e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  57 
 
 
104 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  51.52 
 
 
99 aa  112  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  52.63 
 
 
102 aa  108  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  55.67 
 
 
106 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  53.19 
 
 
104 aa  107  7e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.77187e-06  hitchhiker  2.75713e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  51 
 
 
106 aa  106  9e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  54.26 
 
 
104 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  50.52 
 
 
102 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  49.5 
 
 
104 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  53.19 
 
 
104 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  52.63 
 
 
104 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  53.19 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.07281e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.13477e-08  normal  0.673316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.27919e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66564e-08  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.54579e-07  hitchhiker  7.47363e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.63176e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  51 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.55602e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  49 
 
 
105 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  51.06 
 
 
104 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  49 
 
 
105 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.29176e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  49 
 
 
105 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  9.73663e-05  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  49 
 
 
105 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.05516e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  49 
 
 
105 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  54.55 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  50.51 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  49 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  44 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  48 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  41 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  45 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  44.44 
 
 
105 aa  82  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  43.43 
 
 
99 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  43.43 
 
 
98 aa  80.9  6e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  43.43 
 
 
98 aa  80.9  6e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  42.42 
 
 
98 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 
97 aa  79  2e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  42.42 
 
 
105 aa  77  8e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  38 
 
 
104 aa  75.5  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  47.73 
 
 
89 aa  74.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  40.91 
 
 
101 aa  73.2  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  44.32 
 
 
89 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  41.86 
 
 
95 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  47.13 
 
 
102 aa  72  3e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  46.59 
 
 
91 aa  71.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  46.59 
 
 
98 aa  71.6  3e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  40.4 
 
 
99 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  38.38 
 
 
97 aa  70.1  9e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  44.83 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  46.07 
 
 
100 aa  68.9  2e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  42.22 
 
 
91 aa  69.3  2e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  43.53 
 
 
102 aa  68.2  4e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  44.83 
 
 
101 aa  67  7e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  47.56 
 
 
98 aa  67.4  7e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  41.57 
 
 
93 aa  66.2  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  44.19 
 
 
98 aa  66.2  1e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  42.7 
 
 
108 aa  66.6  1e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.18 
 
 
92 aa  65.9  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  36.63 
 
 
114 aa  63.2  1e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  36.73 
 
 
114 aa  62.8  1e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  42.7 
 
 
94 aa  62.8  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  42.7 
 
 
91 aa  62.4  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  38.64 
 
 
104 aa  62.8  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  45.33 
 
 
90 aa  62.8  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  37.96 
 
 
110 aa  61.6  3e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.29362e-12  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  35.35 
 
 
101 aa  61.2  4e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  38.82 
 
 
96 aa  60.5  8e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  43.9 
 
 
93 aa  60.1  9e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  42.47 
 
 
101 aa  59.7  1e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  38.2 
 
 
101 aa  58.5  3e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 
161 aa  58.2  4e-08  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  40.24 
 
 
92 aa  57.4  6e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  40.24 
 
 
92 aa  57.4  6e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  38.64 
 
 
104 aa  57.4  7e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  38.64 
 
 
104 aa  57  8e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  43.42 
 
 
106 aa  56.2  1e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  40.26 
 
 
85 aa  55.8  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>