26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0501 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  350  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  25.68 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  26.74 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  23.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  28.76 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  28.65 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  23.08 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  26.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  22.16 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  27.4 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  26.42 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  25.79 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  25.79 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  25.79 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  24.2 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  22.81 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  22.81 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  24 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  41.54 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  23.03 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  22.81 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  24.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  21.95 
 
 		 203 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  21.85 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>