More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1842 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.55764e-09  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.43772e-09  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.31479e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  100 
 
 
143 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.39379e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  95.77 
 
 
143 aa  284  3e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  95.77 
 
 
143 aa  282  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.88037e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  95.77 
 
 
143 aa  282  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.80206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  95.77 
 
 
143 aa  282  1e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  92.96 
 
 
161 aa  280  4e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.1646e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  95.07 
 
 
143 aa  280  4e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.68341e-06  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  92.31 
 
 
143 aa  279  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.22874e-08  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  92.31 
 
 
143 aa  278  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  91.61 
 
 
143 aa  276  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  89.44 
 
 
143 aa  270  4e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.66153e-09  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  88.73 
 
 
169 aa  268  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  84.51 
 
 
143 aa  257  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.3166e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  78.72 
 
 
147 aa  238  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  78.72 
 
 
149 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  78.72 
 
 
149 aa  238  3e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  78.17 
 
 
150 aa  234  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.86155e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  75.35 
 
 
148 aa  233  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.81175e-07  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  73.65 
 
 
150 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  6.79753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  73.65 
 
 
150 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.60215e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.77584e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.82448e-07  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
150 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.38653e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  73.65 
 
 
150 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  73.65 
 
 
150 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.69196e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  74.65 
 
 
148 aa  229  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.69107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  74.13 
 
 
148 aa  228  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  73.94 
 
 
148 aa  226  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  72.73 
 
 
148 aa  222  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.06726e-07  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  72.03 
 
 
149 aa  221  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  72.03 
 
 
149 aa  221  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  71.33 
 
 
148 aa  219  1e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  71.33 
 
 
148 aa  219  1e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  70.63 
 
 
148 aa  216  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.35806e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  72.14 
 
 
142 aa  214  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  70.71 
 
 
147 aa  211  2e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  70.9 
 
 
140 aa  207  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  72.26 
 
 
142 aa  195  2e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 
136 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  60.87 
 
 
148 aa  174  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 
150 aa  171  4e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  55.4 
 
 
143 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  55.56 
 
 
144 aa  170  7e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  55.07 
 
 
146 aa  169  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  60.45 
 
 
152 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  54.81 
 
 
144 aa  168  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  55.8 
 
 
142 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  55.15 
 
 
159 aa  167  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  58.02 
 
 
136 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  58.02 
 
 
136 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  59.52 
 
 
158 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  59.52 
 
 
158 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  57.58 
 
 
143 aa  166  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  56.74 
 
 
143 aa  166  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  56.72 
 
 
141 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  57.81 
 
 
140 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  57.69 
 
 
135 aa  163  6e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.1899e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  60.32 
 
 
140 aa  163  7e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
143 aa  161  2e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 
139 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
142 aa  160  5e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
142 aa  160  5e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  55.94 
 
 
145 aa  160  5e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
142 aa  160  5e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
142 aa  160  5e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  54.26 
 
 
145 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  4.98211e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  54.26 
 
 
155 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.0196e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
143 aa  159  8e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  57.94 
 
 
134 aa  160  8e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  57.94 
 
 
139 aa  159  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  52.82 
 
 
147 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  58.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  56.72 
 
 
143 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
142 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  56.72 
 
 
143 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  56.72 
 
 
143 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  57.14 
 
 
134 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  54.48 
 
 
149 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  58.65 
 
 
142 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  8.88993e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
142 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
142 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  2.83641e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
134 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  8.21406e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>