37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0016 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0192    99.14 
 
 		 774 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  99.43 
 
 		 819 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0016    100 
 
 		 360 bp  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  90.91 
 
 		 819 bp  430  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  90.91 
 
 		 819 bp  430  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  90.62 
 
 		 885 bp  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  90.62 
 
 		 819 bp  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  90.62 
 
 		 1140 bp  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  90.62 
 
 		 819 bp  422  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0312    90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  90.32 
 
 		 819 bp  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  90.03 
 
 		 819 bp  406  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  90.03 
 
 		 819 bp  406  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  90.03 
 
 		 819 bp  406  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  90.03 
 
 		 819 bp  406  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0082    98.92 
 
 		 189 bp  353  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2980    95.3 
 
 		 523 bp  240  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0192958  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  83.56 
 
 		 735 bp  50.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>