127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0167 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1413  AMP nucleosidase  68.34 
 
 		 494 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.43722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0167  AMP nucleosidase  100 
 
 		 493 aa  1006    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2669  AMP nucleosidase  65.42 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3127  AMP nucleosidase  62.42 
 
 		 486 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1823  AMP nucleosidase  63.58 
 
 		 486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1423  AMP nucleosidase  62.91 
 
 		 484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4704  AMP nucleosidase  61.92 
 
 		 484 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.591798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2572  AMP nucleosidase  61.88 
 
 		 484 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1215  AMP nucleosidase  62.71 
 
 		 485 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01894  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1671  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2105  AMP nucleosidase  61.68 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2264  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000140487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1661  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00901346  normal  0.0509963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1143  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000908375  hitchhiker  0.00000131711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2824  AMP nucleosidase  61.89 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  0.783783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2179  AMP nucleosidase  62.68 
 
 		 484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00600152  normal  0.598678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2231  AMP nucleosidase  62.68 
 
 		 484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2167  AMP nucleosidase  62.68 
 
 		 484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000113485  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2112  AMP nucleosidase  62.29 
 
 		 484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000296443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2344  AMP nucleosidase  62.89 
 
 		 484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0273914  hitchhiker  0.00120533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2827  AMP nucleosidase  62.03 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1846  AMP nucleosidase  60.33 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1955  AMP nucleosidase  60.12 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0408  AMP nucleosidase  57.02 
 
 		 492 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0986  AMP nucleosidase  67.1 
 
 		 382 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000563719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4942  AMP nucleosidase  54.81 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4833  AMP nucleosidase  56.13 
 
 		 487 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4779  AMP nucleosidase  56.13 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.549989  decreased coverage  0.00166711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4655  AMP nucleosidase  56.13 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370825  normal  0.206703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0641  AMP nucleosidase  56.13 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4795  AMP nucleosidase  54.18 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4337  AMP nucleosidase  53.77 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.298005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3750  AMP nucleosidase  54.49 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.963566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12490  AMP nucleosidase  51.41 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0681  AMP nucleosidase  55.87 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114731  normal  0.0716932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1138  AMP nucleosidase  51.2 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4233  AMP nucleosidase  54.45 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00168339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09370  AMP nucleosidase  53.94 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0708  AMP nucleosidase  55.65 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  0.140174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0721  AMP nucleosidase  55.65 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5425  AMP nucleosidase  51.65 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4743  AMP nucleosidase  51.72 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5885  AMP nucleosidase  50.62 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0454  AMP nucleosidase  50.5 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1155  AMP nucleosidase  50.71 
 
 		 493 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0214  AMP nucleosidase  54.98 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3569  AMP nucleosidase  48.99 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0254113  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4876  AMP nucleosidase  49.39 
 
 		 526 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501622 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0857  AMP nucleosidase  49.39 
 
 		 508 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0315968  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0602  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3545  AMP nucleosidase  48.69 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4036  AMP nucleosidase  54.74 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3922  AMP nucleosidase  54.74 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0309  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2838  AMP nucleosidase  47.93 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1489  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1685  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2553  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.325528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2416  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0341  AMP nucleosidase  49.19 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3766  AMP nucleosidase  48.78 
 
 		 508 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00262282  decreased coverage  0.000373765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4414  AMP nucleosidase  48.4 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1488  AMP nucleosidase  55.02 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0088  AMP nucleosidase  49.2 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2227  AMP nucleosidase  48.58 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4496  AMP nucleosidase  48.58 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168653  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3237  AMP nucleosidase  48.78 
 
 		 508 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0388268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3869  AMP nucleosidase  48.58 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3658  AMP nucleosidase  48.58 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6793  AMP nucleosidase  47.53 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00470693  hitchhiker  0.00000107596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0642  AMP nucleosidase  48.39 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0485  AMP nucleosidase  49.28 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3709  AMP nucleosidase  49.28 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.456072  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1114  AMP nucleosidase  52.83 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2794  AMP nucleosidase  53.08 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2704  AMP nucleosidase  47.53 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1414  AMP nucleosidase  52 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1387  AMP nucleosidase  52.39 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0347338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0404  AMP nucleosidase  51.93 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0054  AMP nucleosidase  52.16 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4957  AMP nucleosidase  46.96 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1201  AMP nucleosidase  48.28 
 
 		 498 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0963  AMP nucleosidase  52.61 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0623  AMP nucleosidase  49.17 
 
 		 500 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.625588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0916  AMP nucleosidase  51.8 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0622  AMP nucleosidase  49.17 
 
 		 500 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0658  AMP nucleosidase  51.77 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3289  AMP nucleosidase  49.09 
 
 		 489 aa  422  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4246  AMP nucleosidase  47.89 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0337  AMP nucleosidase  51.94 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2800  AMP nucleosidase  50.8 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2656  AMP nucleosidase  46.92 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3701  AMP nucleosidase  51.56 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3401  AMP nucleosidase  49.55 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  44.87 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  32.99 
 
 		 277 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  32.09 
 
 		 258 aa  130  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  29.9 
 
 		 287 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  31.12 
 
 		 256 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>