77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1990 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  61.29 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  46.77 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  45.24 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  50 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  53.57 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  47.46 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  57.69 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  39.39 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  42.37 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  45.16 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  48.28 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  46.55 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  46.55 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.27 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  43.28 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  39.39 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.39 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  38.81 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.39 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  45.9 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.31 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.39 
 
 		 74 aa  47.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  51.85 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  51.92 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  38.1 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  41.51 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  40 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  35.82 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  52.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  38.98 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  52.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.4 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  48.94 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  37.29 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  37.29 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0832  hypothetical protein  34.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17612  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  43.1 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  40.98 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.85 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  40.35 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  36.36 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  35.21 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  32.84 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  32.39 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  37.31 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  39.66 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  33.85 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  35.59 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  35.94 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.59 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.33 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  36.84 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  31.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  28.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  28.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  28.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  34.48 
 
 		 72 aa  40  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>