138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2887 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  93.71 
 
 		 175 aa  342  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  93.71 
 
 		 175 aa  342  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  92 
 
 		 175 aa  337  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  84.57 
 
 		 188 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  84 
 
 		 179 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  83.43 
 
 		 179 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  83.43 
 
 		 175 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  82.29 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  69.64 
 
 		 169 aa  250  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  66.27 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  63.31 
 
 		 169 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  67.06 
 
 		 171 aa  243  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  62.65 
 
 		 172 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  55.83 
 
 		 175 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  53.25 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  50.35 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  45.68 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  44.31 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  43.83 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  42.35 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  41.76 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  45.57 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  41.76 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  41.76 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  41.76 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  45.96 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  40.94 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  43.51 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  39.41 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  39.41 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  39.41 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  43.04 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  39.41 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  38.82 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  40.7 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  38.92 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  38.32 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  40.24 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  44.44 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  46.34 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  27.43 
 
 		 212 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  32.91 
 
 		 169 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  30.29 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  31.79 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  30.51 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  31.07 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  29.78 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  31.74 
 
 		 218 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  31.9 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  34.27 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  29.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  29.79 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  35.07 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  29.73 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  29.08 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  35.42 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  32.19 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  33.07 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  29.73 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  28.37 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  31.76 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  32.67 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  34.56 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  35.71 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  27.21 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  34.04 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  28.78 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  31.51 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  32.17 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  32.17 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  29.94 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  26.25 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  28.3 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  26.25 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  28.37 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  30.26 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  31.94 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  31.94 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  31.94 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  30.71 
 
 		 1210 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  29.31 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  31.03 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  32.43 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  23.35 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  27.71 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  28.99 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>