140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1317 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  57.07 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  55.73 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  55.43 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.3 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  55.26 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.81 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.19 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.37 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.81 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.5 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  50.27 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  52.13 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  54.59 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.41 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.55 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  50.82 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  53.76 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.27 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  48.8 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.03 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  45.16 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.34 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  51.35 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.38 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  50.8 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.5 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.5 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  48.65 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  51.03 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.04 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.53 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.01 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  47.76 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.52 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.5 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.18 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  50.54 
 
 		 190 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  49.74 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  47.45 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  51.1 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.95 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.57 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  50 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.41 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.57 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  46.49 
 
 		 192 aa  168  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.57 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  50 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.49 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.96 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  48.42 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  45.45 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.16 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.16 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  48.17 
 
 		 219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  48.95 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  48.72 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  41.85 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  47.67 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.11 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  47.18 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  48.17 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  45.79 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  47.8 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  49.48 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.19 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.88 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.19 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.72 
 
 		 189 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.59 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  46 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.65 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  48.47 
 
 		 196 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.99 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.24 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.24 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.63 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.01 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  44.88 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.2 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  49.47 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1753  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.39 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.49529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  43.5 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  47.37 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.68 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.31 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.77 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  40.61 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0928  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.85 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  40 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.36 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.03 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  44.26 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>