23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1232 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  99.39 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  79.45 
 
 
164 aa  244  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  51.79 
 
 
169 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  49.08 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  54.35 
 
 
185 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  40.76 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  49.44 
 
 
163 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  45.35 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  34.57 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  37.23 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  39.74 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  33.09 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  32.1 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  39.31 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  30.46 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  32.63 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  48.39 
 
 
198 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  30.53 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  48.84 
 
 
58 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>