240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1665 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 61 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 59 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  76.79 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  76.79 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  73.21 
 
 		 59 aa  91.3  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  69.64 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  69.64 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  67.86 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  69.64 
 
 		 59 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  63.79 
 
 		 67 aa  84.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1718  50S ribosomal protein L32  64.91 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220434  normal  0.0708692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  64.91 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  61.4 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 60 aa  73.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1904  50S ribosomal protein L32  57.38 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0519443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1579  50S ribosomal protein L32  57.38 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.146664  normal  0.0105145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  58.33 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  56.14 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  61.82 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1229  50S ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2559  ribosomal protein L32  64.15 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1873  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00104363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3110  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1152  50S ribosomal protein L32  56.9 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  58.62 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 57 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  59.65 
 
 		 57 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1740  50S ribosomal protein L32  56.67 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000325807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 59 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  50.88 
 
 		 57 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 59 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2988  ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000138033  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  60 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  57.14 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1369  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00758434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  54.1 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  57.14 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  53.7 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  54.39 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1355  LSU ribosomal protein L32P  50.91 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130715  normal  0.0921955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  58.18 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  52.46 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0952  ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000023662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl396  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00156688  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  55.36 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  49.09 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  52.73 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  49.15 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0656  ribosomal protein L32  53.57 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  49.12 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0195  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.223455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0940  ribosomal protein L32  50 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1729  ribosomal protein L32  51.79 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000316991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0201  50S ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf408  ribosomal protein L32  48.15 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0657  ribosomal protein L32  47.37 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1275  50S ribosomal protein L32  45.9 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3692  ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0171  50S ribosomal protein L32  50.82 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2488  50S ribosomal protein L32  52.54 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  47.46 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0184  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00725165  normal  0.800579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0667  50S ribosomal protein L32  51.85 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.728717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0987  50S ribosomal protein L32  48.33 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0135  50S ribosomal protein L32  49.18 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114527  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0233  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000487517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1259  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000760142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1376  50S ribosomal protein L32  62.07 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.179787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1625a  50S ribosomal protein L32  44.26 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100343  normal  0.018062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2134  50S ribosomal protein L32  47.27 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000309957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1975  50S ribosomal protein L32  50 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.536749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>