25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4991 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  38.13 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  37.09 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  34.87 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  32.58 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  34.64 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  34.64 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  34.09 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  32.52 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  31.37 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  33.75 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  31.06 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  31.01 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  29.8 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  30.64 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  34.84 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  33.12 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  31.87 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  28.75 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  27.38 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  22.7 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>