24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3719 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  929    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  30.2 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  31.74 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  30.75 
 
 		 404 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  23.82 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  26.49 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  26.2 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  21.85 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  25.77 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  29.41 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  31.15 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  29.34 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  28.8 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  28.82 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  31.25 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  29.61 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  29.61 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  28.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  29.61 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  29.61 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.72 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  30.08 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>