12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4324 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4324  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1212    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.534524  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4427  hypothetical protein  81.77 
 
 		 620 aa  902    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0021  WD40 domain protein beta Propeller  38.6 
 
 		 684 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4038  hypothetical protein  32.51 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 771 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.57 
 
 		 656 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.09 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  57.14 
 
 		 1159 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.48 
 
 		 440 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.6 
 
 		 1005 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.25 
 
 		 695 aa  43.9  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>