More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3339 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  91.3 
 
 
290 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0868  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.93 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.514857  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.46 
 
 
305 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.08 
 
 
290 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
282 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.73 
 
 
263 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
299 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.47 
 
 
282 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.19 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.04165  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0804  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.35 
 
 
305 aa  171  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.01 
 
 
297 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.39 
 
 
293 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.66 
 
 
285 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.31 
 
 
279 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.31 
 
 
279 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.13 
 
 
293 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.1 
 
 
257 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.59 
 
 
378 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.92 
 
 
285 aa  165  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.64 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.61 
 
 
409 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.58 
 
 
269 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
865 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.23 
 
 
289 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
290 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
954 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
954 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.67 
 
 
278 aa  159  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.15 
 
 
251 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.23 
 
 
327 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.16 
 
 
327 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.175815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1685  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.61 
 
 
396 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.15 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.52 
 
 
270 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.42 
 
 
342 aa  155  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
354 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.55 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.75 
 
 
279 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.75 
 
 
279 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.15 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.15 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3394  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
390 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
270 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2513  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.95 
 
 
362 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.03 
 
 
250 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.8 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.13 
 
 
303 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.6 
 
 
295 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.57 
 
 
354 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  40.08 
 
 
372 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.31 
 
 
297 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.92 
 
 
372 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3073  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.16 
 
 
347 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171179  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.77 
 
 
345 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
270 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
498 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.03 
 
 
323 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.18 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.71 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.18 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.25 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.34 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.94 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1553  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.19 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.880731 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4457  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.46 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0207952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.08 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
303 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.13 
 
 
322 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3597  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.77 
 
 
767 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136017  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.1 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.23 
 
 
314 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.87 
 
 
409 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.97 
 
 
289 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1502  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.93 
 
 
303 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.75 
 
 
820 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
371 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.9 
 
 
297 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1934  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.22 
 
 
387 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0138413  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.82 
 
 
292 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0429  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.71 
 
 
279 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.11 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1736  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.45 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0556739  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.79 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1076  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.74 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0236556  normal  0.51143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.88 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0191  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.8 
 
 
277 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.95258  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.8 
 
 
277 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.09 
 
 
261 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.875971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.49 
 
 
356 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.760314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2491  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.6 
 
 
344 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1209  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.97 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4470  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.08 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.08 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>