More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0804 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0804  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.15 
 
 
315 aa  343  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.04165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.54 
 
 
388 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.52 
 
 
290 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.21 
 
 
354 aa  254  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.81 
 
 
325 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.74 
 
 
285 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2491  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.45 
 
 
344 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.52 
 
 
378 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 
954 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 
954 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.1 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1502  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.79 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  45.59 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.65 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
323 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3073  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.49 
 
 
347 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171179  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.29 
 
 
371 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4457  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.31 
 
 
319 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0207952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.1 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3394  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.69 
 
 
390 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1685  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.92 
 
 
396 aa  225  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.16 
 
 
409 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.14 
 
 
322 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.53 
 
 
334 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 
865 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2513  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.84 
 
 
362 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4470  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.33 
 
 
293 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.33 
 
 
293 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693008  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4201  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.33 
 
 
293 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
498 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.7 
 
 
307 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.21 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.175815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1934  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
387 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0138413  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.06 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.760314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1076  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.75 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0236556  normal  0.51143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.66 
 
 
327 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.49 
 
 
820 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.21 
 
 
409 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.34 
 
 
345 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.53 
 
 
342 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3340  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.23 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469594  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.11 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.54 
 
 
585 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3597  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.64 
 
 
767 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136017  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
314 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11630  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.3 
 
 
468 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.91 
 
 
282 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.35 
 
 
276 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.36 
 
 
290 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0868  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.56 
 
 
291 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.514857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
250 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.01 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.11 
 
 
320 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.94 
 
 
290 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.46 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.33 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.8 
 
 
305 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
270 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
270 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.07 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.84 
 
 
251 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.21 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.94 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.25 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35 
 
 
285 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
279 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
279 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.66 
 
 
303 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.06 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.06 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.86 
 
 
297 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.2 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.83 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.98 
 
 
277 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0191  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.98 
 
 
277 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.95258  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.16 
 
 
293 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.47 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.25 
 
 
293 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.5 
 
 
275 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
271 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
289 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
305 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.148056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.43 
 
 
297 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0429  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.44 
 
 
279 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.07 
 
 
292 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0047  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.69 
 
 
262 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000638304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0046  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.69 
 
 
262 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.02 
 
 
270 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>