87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3439 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 149 aa  305  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4070  GCN5-related N-acetyltransferase  69.4 
 
 		 149 aa  189  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.989966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3957  GCN5-related N-acetyltransferase  69.4 
 
 		 149 aa  189  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.762591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3274  GCN5-related N-acetyltransferase  66.93 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1681  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2015  acetyltransferase, GNAT family  50.34 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3106  GCN5-related N-acetyltransferase  53.96 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3946  GCN5-related N-acetyltransferase  51.91 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197235  normal  0.746328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3518  GCN5-related N-acetyltransferase  48.48 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  48.48 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4870  GCN5-related N-acetyltransferase  42.96 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3075  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2587  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1786  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1938  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.926851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2185  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2488  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2117  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2171  acetyltransferase  31.54 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1891  acetyltransferase  32.31 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2086  acetyltransferase  32.31 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1939  acetyltransferase  32.31 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4971  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1901  acetyltransferase  32.31 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00182478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2296  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119831  normal  0.70533 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3927  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  36.44 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2908  GCN5-related N-acetyltransferase  38.58 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2334  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  34.75 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.142661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3993  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1568  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3229  acetyltransferase, GNAT family  29.46 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.324483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2076  acetyltransferase, GNAT family  27.91 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0646  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09668  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21450  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.65 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.464847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1505  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0556  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0716622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4755  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.267052  normal  0.667871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2560  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1206  acetyltransferase  29.69 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1082  acetyltransferase  29.69 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4001  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5019  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4216  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  32 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  26.09 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 147 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2339  acetyltransferase, GNAT family  24.43 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  21.23 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.246804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12180  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.63 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6430  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.982998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2639  acetyltransferase  19.38 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0724929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0151  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0297  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.216533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16690  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.46 
 
 		 195 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.499497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 		 149 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>